三、化学破碎法：指利用甲醛、丙酮等有机溶剂或表面活性剂作用于细胞膜，使细胞膜的结构遭到破坏或透性发生改变 。
有些动物细胞，例如肿瘤细胞可采用十二烷基磺酸钠（sds）、去氧胆酸钠等细胞膜破坏。浓度一般为1mg/ml。
四、酶学破碎法 ：选用合适的酶，使细胞壁遭到破坏，进而在低渗溶液中将原生质体破碎开来。
细菌细胞壁较厚，可采用*处理效果更好。
裂解液标准配方: ：50mm tris-hcl(ph8.5~9.0), 2mm edta, 100mm nacl, 0.5% triton x-100, 1mg/ml*。(*在这个ph范围内比较好发挥作用) 。
综合叙述：无论用哪一种方法破碎组织细胞，都会使细胞内蛋白质或核酸水解酶释放到溶液中，使大分子生物降解，导致天然物质量的减少，加入二异丙基氟磷酸（dfp）可以抑制或减慢自溶作用；加入碘乙酸可以抑制那些活性中心需要有疏基的蛋白水解酶的活性，加入pmsf也能清除蛋白水解酶活力，但不是全部，而且应该在破碎的同时多加几次；另外，还可通过选择ph、温度或离子强度等，使这些条件都要适合于目的物质的提取。